Диагностицирането на гонореята обикновено става след съответни оплаквания на болния. Много често при боледуване на единия партньор и профилактично изследване на другия, у него се откриват гонококи без започнала клинична проява. Това е най-добрият вариант, защото колкото по-рано започне лечението, толкова по-добре е за цялостната прогноза за протичането на болестта.

От голямо значение е поставянето на диагнозата да не се базира само на симптомите, защото гонореята може да бъде объркана с други венерически заболявания. Най-използваните диагностични методи са:
o оцветяване на материал с метиленово синьо - наблюдават се бактериите по двойки, вътре в белите кръвни клетки (където е нормалното им разположение).
o оцветяване по Грам - налага се при смесена инфекция. Тук гонококите са розови.
- Посяване на култура от гонококите - културелно изследване
Този метод има огромно значение не само за поставяне на диагнозата, но и за определяне на резултатите от лечението. Взимат се материали от уретрата, еякуата, ректума, фаринкса и др. Резултатът от това изследване е най-важен за медицинската практика.
